高雄醫學大學課程將基礎與臨床整合，以器官系統(Organ system)單元授課，並輔以問題導向(PBL)的小組教學方式與團隊導向(TBL)，培養學生主動、積極、多元、獨立思考的學習精神；課程著重學生的自我學習與應用，使理論與臨床並重，實踐全人照護所需具備的知識、技能與態度。

在實習的課程中，學生藉由實際參與臨床工作，親身體驗醫病的互動與關懷，整體課程以PBL、OSCE及Case Demonstration來強化學生的臨床技能，培養學生自我導向學習的精神與實務。

通識及醫學倫理教育則讓學生在具備專業醫學知識之外，成為一位具有豐富人文素養以及良好溝通技巧的醫學工作者，透過人文講座課程及醫學倫理個案討論培養術德兼修、以人為本、關懷生命的優秀醫學人才。

除此之外，與國際接軌更是高醫長期以來教育的重點，為了增進學生的國際競爭力，並聘請哈佛大學、香港大學等國外知名學者來台授課，學生將來也有機會前往哈佛大學、夏威夷大學等知名醫學院進行見習與實習的交流，多項課程安排都讓學生有更多機會能夠開拓視野、增廣見聞，成為一位兼具關懷鄉土也放眼世界的優秀醫者。